Im Jahr 1988 wurde das Forschungsinstitut von der Medizinischen Abteilung der Stiftung Schweizerisches Forschungsinstitut für Hochgebirgsklima und Medizin Davos (SFI) gegründet. Seit 1996 ist das Institut der Universität Zürich angegliedert und seit 2009 Mitglied der Life Science Zurich Graduate School, einem gemeinsamen Ausbildungs-Projekt der Universität Zürich und der ETH Zürich. Die Forschung am SIAF konzentriert sich auf die patientenrelevante translationale Forschung und Untersuchung der immunologischen Grundlagen allergischer und asthmatischer Erkrankungen, die Ansatzpunkte für neue präventive und kurative Behandlungen zugunsten der Betroffenen schaffen. Es sollen Behandlungsansätze entwickelt werden, die besser auf die einzelnen Betroffenen zugeschnitten sind und die individuelle Symptomausprägung des jeweiligen Patienten besser berücksichtigen.
Das stetig wachsende SIAF ist heute ein führendes Institut auf seinem Gebiet und organisiert jährlich das international angesehene World Immune Regulation Meeting (WIRM).